Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms