Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms