Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms