Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL2Q6F5E8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms