Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms