Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms