Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms