Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CC2D1BQ5T0F9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms