Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMPD1Q5SYB0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms