Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms