Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms