Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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