Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms