Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms