Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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