Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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