Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms