Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms