Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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