Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FSCN1Q16658 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms