Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms