Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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