Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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