Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms