Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms