Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CST6Q15828 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CST6Q15828 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CST6Q15828 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CST6Q15828 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CST6Q15828 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CST6Q15828 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CST6Q15828 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CST6Q15828 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms