Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNA6Q15825 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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