Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms