Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGN3Q15651 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HMGN3Q15651 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HMGN3Q15651 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HMGN3Q15651 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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HMGN3Q15651 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HMGN3Q15651 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGN3Q15651 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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