Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SF1Q15637 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SF1Q15637 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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