Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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