Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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