Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD4Q14839 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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