Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IHHQ14623 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IHHQ14623 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IHHQ14623 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IHHQ14623 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IHHQ14623 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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