Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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