Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPARCL1Q14515 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms