Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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UBE4AQ14139 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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UBE4AQ14139 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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UBE4AQ14139 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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UBE4AQ14139 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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UBE4AQ14139 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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UBE4AQ14139 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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