Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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