Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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