Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CUL3Q13618 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CUL3Q13618 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CUL3Q13618 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CUL3Q13618 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CUL3Q13618 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL3Q13618 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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