Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms