Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms