Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2BQ13554 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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