Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TARBP1Q13395 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TARBP1Q13395 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms