Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLD1Q13393 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms