Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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