Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATMQ13315 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATMQ13315 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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