Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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