Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXC1Q12948 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXC1Q12948 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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