Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX10Q12887 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX10Q12887 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX10Q12887 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX10Q12887 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COX10Q12887 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms